Д-р Лилия Вакрилова завършва висшето си медицинско образование в Медицински университет – София. Сспециалност по педиатрия получава през 1992 г. И по неонатология през 1998 г. Има успешно завършени курсове по трансфонтанелна ехография и ехография в детската възраст.
От 1985 до 1989 г. работи в Детско отделение на Окръжна болница – Благоевград. Близо година в ІІІ- та Градска болница в столицата, отново в Детско отделение.
От 1989 г. е част от състава на УСБАЛАГ „Майчин дом”, Клиника по неонатология като последователно заема длъжностите – асистент до 1991г, старши асистент до 1995 г. и главен асистент от 1998 г.
В момента д-р Вакрилова е началник на отделение – главен асистент към отделение „Интензивни грижи“ към Клиника по неонатология.
Специализирала е в Frauenklinik – Bern.
Има над 30 публикации, предимно в списанията „Акушерство и гинекология” и „Педиатрия”.